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秀姑巒溪切穿海岸山脈形成峽谷，總長103公里，全年雨水豐沛，河道曲折蜿蜒，曲流及河階地形發達，一般泛舟河段始自瑞穗終至大港口。瑞穗至奇美段，河道切過新第三紀的砂頁岩，發育成弓形的崖岸區流，兩岸坡度一陡一緩，對比明顯，景觀奇特；奇美至大港口段的河道則切穿安山岩及火成岩，形成深谷曲流，兩岸岩壁陡峻，河水湍急。 & K d. c. u+ h! v4 |& `" h# j3 s, s- Y
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沿著秀姑巒溪從上游瑞穗泛至下游大港口（長虹橋），可看見巨石散佈河床岸際，這些巨石經年受水沖蝕，構成了各種奇形怪狀的「萬物相」，也有皓白的石塊羅列水面，景色極佳，有「秀姑漱玉」之稱，在出海口中央有一火山集塊岩構成的島嶼，為奚卜蘭島，又稱獅球嶼。. H# w) x6 [4 m* t3 W4 i' \1 U
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0 j3 y6 j, `# R) B& t! { 而秀姑巒溪的生態景觀也很可觀，溪谷沿岸的砂地上有耐旱的草本植物，坡地上上各種熱帶植物相，中高海拔山區則有熱帶雨林，植物種類繁多，保存完整；鳥類根據記載多達98種，其中不乏特有或稀有鳥種；河中的淡水魚也多達30餘種，其中被列為文化資產保護對象的高身鏟頷魚，特別珍貴。 6 ?( D$ f( B. U3 T6 I: b * ^/ J; x3 u, U/ H* W Q. ?' V& \" z+ G$ d! D/ D4 _7 X9 c+ W) l
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